EZ-editor™ Gene Knockout Cell Line
Strategy
Dsp Gene Knockout Strategy
EZ-editor™ technology (CRISPR based), developed by Ubigene, is more efficient than general
CRISPR/Cas9 technology in double-strand breaking and homologous recombination. With EZ-editor™, Ubigene has
successfully edited over 10000 genes on more than 500 types of cell lines.
Objective
To create a Rat Dsp Knockout
model in cell line by EZ-editor™-mediated genome engineering.
Target gene info
Organism
Rattus norvegicus
Official full symbol
desmoplakin
Genomic regions
Chromosome 17
Full detail +
Strategy Summary
This gene has 2 protein coding transcripts：
Transcript
Length(nt)
Protein
Length(aa)
Protein name
Transcript type
Transcript name
ccds
XM_017600713
7992
XP_017456202
2278
desmoplakin
3
transcript variant X1
NM_001419598
9491
NP_001406527
2877
desmoplakin
3
View more +
Frame-shift
Fragment A
Fragment B
Strategy
综合难度评估
根据源井生物红棉数据库显示：CRISPR基因编辑方案未知 ,未知 。
EZ-editor™基因风险评估
EZ-editor™基因表达量
EZ-editor™基因拷贝数
EZ-editor™基因风险评估
评估结果
Dsp基因在0%的细胞中属高风险，
由于您未选择具体细胞，我们无法提供精准分数，仅供参考。
基因致死分数
Dependent Cell Lines
Gene Dependency
0
0.5
1
EZ-editor™基因表达量
表达结果
Dsp基因在
所有细胞中有
29.3%细胞不表达，
18.4%细胞低表达，
52.3%细胞中表达，
由于您未选择具体细胞，我们无法提供精准分数，仅供参考。
基因的表达量
Cell Lines Frequency
log2(TPM+1)
0
2
4
6
8
10
12
EZ-editor™基因拷贝数
评估结果
Dsp基因在
所有细胞中有
59.9%细胞拷贝数较低，
35.5%细胞拷贝数中等，
4.5%细胞拷贝数较高，
由于您未选择具体细胞，我们无法提供精准拷贝数，仅供参考。
基因的拷贝数
Copy number
0
1
2
3
4
5
6
7
0 100 200 300 400 500 600 Cell Lines
Work flow
“源”于此，不止于此
源井生物是一家专注于细胞基因编辑的国际化高新技术企业，独家CRISPR-U™专利技术，编辑效率较传统方法高出10-20倍，可轻松完成细胞的基因敲除、点突变与敲入。基于CRISPR-U™技术，源井生物已积累300多种细胞（含iPS/ES）超6000个基因编辑的成功案例，并拥有5000+KO细胞资源库和上万条
gRNA载体现货库。
源井生物注重技术创新和产品开发，其覆盖基因编辑全流程的EZ-editor™系列产品 仍在不断完善，向着“让基因编辑更简单”的企业目标砥砺前行，永不止步！
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